中国银监会《关于加快推进农村合作金融机构股权改造的指导意见》（以下简称《指导意见》）的发布，使极其具有中国特色的金融创新产物。“股份合作制”作为合作制向股份制过度形式将退出历史的舞台，这无疑推动了农村合作金融机构加快企业组织形式改组转制步伐。因此，农村合作金融机构股权改造应处理好以下四个关系。

　　第一，要处理好股权转换与公司治理、行业推动及企业改制的关系。

　　农村信用社要建立科学的实施方案，报银监部门审核，为提交法律程序奠定基础。

　　银监部门应充分发挥政策指导作用，一方面搞好政策和相关改革文本的培训工作，统一操作行为；另一方面建立和完善受理、审查工作程序，推动股权改造的有序进行。

　　股权转换必须符合公司法有关规定，在充分征求股东的意见的基础上进行，并交股东大会表决通过和律师见证。此后，按股份制要求，建立和完善法人治理制度，并依法通过。

　　第二，应处理好募股总量与经济环境、收入水平及自身发展的关系。

　　在股改工作中，一方面要注重引导法人股收购自然人股权；另一方面强化自然人间的股权流动。

　　同时，还要考虑财务承受能力。要预测出年预期利润水平和可分配的红利，按财务制度规定，预测出每股的盈利分配水平，按照不低于现行两年期档次储蓄存款利率水平，反向推算出可募股的总额，以确保股本金的保值增值和资本金的稳定。否则，股改工作会造成股金贬值，无疑增加了许多不稳定因素。

　　第三，应处理好结构设计与股金稳定、预防控制及经营趋向的关系。

　　股金结构对股金的稳定、企业的控制力和经营趋向有着至关重要的因素。为确保股金稳定，防范内外人控制，端正经营方向就必须把好以下工作。

　　一是选好法人股东。有意向入股农村合作金融的企业必须是主业突出、治理良好、利益独立、资金实力强、经营稳定的企业，特别是把好持股比例5%以上的股东资格。

　　二是推行股权委托代理制度。即要防止内部人控制，也要防止外部人控制。

　　三是积极引进战略投资者，不仅吸收资本金，而且还要有新的经营理念、经营方式来嫁接金融企业。

　　四是建立市场化的股权定价和流转机制，确保股权的有序流动。

　　第四，应处理好法人治理与社会监督、行业管理及经营行为的关系。

　　《指导意见》规定：“按照股份制方向，全面改造产权关系，明确资本属性，强化资本约束。”“在2015年底前取消资格股。”伴随着股权改造，法人治理应做好以下工作：

　　修改《章程》,建立和完善适应新股权下的股份制组织架构及管理体系；

　　进一步加大社会中介审计的作用,强化社会监督职能；

　　强化银行业监督管理职能建设,管好法人,管住风险,建立和完善市场准入和退出机制,入市规范，退出无险；

　　发挥货币政策的指导，处理好金融产品创新与风险关系，确保金融企业健康发展。